@jzlatko
Nije problem formatirati D particiju nego posle brisanja jednog os-a iz dual boot-a ni taj Windows što se nalazi na C neće se verovatno podići.
U slučaju da se to desi onda ti treba instalacioni cd i sprovesti postupak opisan ovde :
http://www.ehow.com/how_6645707_repair-windows-xp-mbr.html
Samo brisanje ili formatiranje D particije ide ovim postupkom :
Desni klik na My Computer>Manage> Disk Management>Desni klik na D particiju>Format (ili Delete Logical Drive))