Možda ti pomogne i komanda
bootcfg /rebuild
Ja je nikada nisam koristio i nije mi baš najjasnije čemu služi, ali izgleda da pomaže kod problema sa bootovanjem. Proveri i tu komandu na googlu ako ti ništa drugo ne pomogne.
Evo malo podataka o toj komandi:
http://support.microsoft.com/kb/291980